أنشأت الإدارة فى الثلاثينات تحت مسمى مكتب الشئون العامة وتم تغيير المسمى فى الأربعينات بمسمى إدارة الشئون العامة وفى مطلع الستينات تم تطوير الإدارة وسميت بإسم إدارة الشئون العامة والتوجية المعنوى.
في عام 1966 تم التطوير والعمل فى صورة إدارتين ( إدارة الشئون المعنوية – إدارة التوجيه المعنوى ) ثم أُعيد تنظيم إدارة الشئون المعنوية للقوات المسلحة عام 1973 ليكون إدارة واحدة هى إدارة الشئون المعنوية للقوات المسلحة.